Секретных миссий в игре обнаружено не много, но все они очаровательны.
Первые две секретные миссии даются в начале. Если пройти первую миссию очень быстро, вторая будет секретной. Если пройти вторую тоже быстро, тогда после неё опять будет секретная.
Третья секретная миссия даётся после 6-й, со спасением капсулы Доктора Мишимы. Если разрушить колонну, стоящую рядом с капсулой - следующая будет одна миссия, если оставить колонну в покое - дадут другую.
Четвёртая секретная миссия даётся после 11-й миссии, на ИО, с воздушной потдержкой наземной операции против базы MCGA. Если выполнить задание быстрее 15ти минут - следующая миссия будет одна, если опоздать к этому сроку - другая. Наверняка есть ещё секретные миссии. Будем искать :)

Итак найден способ как раскрыть любую миссию в игре, не проходя предыдущие. Даже секретные. Идёи в диррикторию Lander/Missions и переименовываем дирикторию Mercury в Mercury1. Это перва миссия в игре.
Теперь что бы подставить вместо первой миссии в игру другую, достаточно переименовать дирикторию с соответствующей миссии планетой в Mercury и вуаля, при входе в игру первая мисси будет та, котора была переименована.
Если в дириктории две миссии 1 и 2, просто переименовываем 2 в 1 и будет открыта вторая. Главное запомнить всё как было что бы если что - вернутьс обратно.
И таким образом была открыта нова миссия на планете Нептун. Номер миссии 2. Итак переименовав Neptun в Mercury а внутри дирриктории поддирикторию 2 в 1 при сиарте мы попадём в новую нептунскую миссию.
Для только что бы пройти этот слоный уровень надо будет закупить корабли помощьнее, а потому пользоваться трейнером в этой миссии - обязательно. Трейнер в разделе Download, качаем, ставим, запускаем. В игре по F5 дают деньги, на что можно купить Роше или Дистрию и вперёд !
Новая Миссия очень сложная, что не может не радовать нашего брата.
Удачи !